产品中心
MeRIP-seq
发布时间: 2022-02-20 17:33
产品介绍
m6A（N6-methyladenosine）是RNA腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰，是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。m6A修饰在肥胖、癌症、突触信号传递、精子发育、卵子发生、干细胞分化、减数分裂、昼夜节律等生物学过程发挥重要作用。m6A修饰过程中有三大类酶发挥重要作用，分别是Writers、Erasers和Readers。Writers即m6A甲基转移酶（m6A methyltransferase ）主要包括METTL3、METTL14、WTAP等。去甲基化酶包括FTO和ALKBH5等。识别甲基化酶包括YTH结构域蛋白、hnRNP以及eIF等。m6A残基分布在mRNA的5′UTR和3′UTR，核心motif是G[G/A]A*CU（*表示潜在的m6A位点）。主要影响mRNA的可变剪切、调节mRNA的翻译及降解。m6A-seq是基于免疫共沉淀的原理结合测序在全转录组水平上定位m6A修饰。RNA甲基化免疫共沉淀 （Methylated RNA Immunoprecipitation，MeRIP）基于 m6A 特异性抗体识别并结合 mRNA 上 m6A 的原理，以 RNA 免疫共沉淀方法富集甲基化修饰片段为基础，并联合高通量测序，研究发生 m6A 甲基化修饰的 mRNA 区域。
技术参数
分析流程
元莘优势
专业化的实验团队，提供高精准度的测序数据
依据研究目的，制定个性化的研究方案，专业化的生物信息学分析
高水平生信团队，团队成员拥有10年的基因组项目经验，已在Nature、NG、NC、MBE、PNAS上发表多篇高分文章
分析示例
peak峰检出及基序分析
GO富集和KEGG富集图
