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10×Visium空间转录组测序
    发布时间: 2022-01-19 10:31    
10×Visium空间转录组测序

产品简介


10× Visium 空间转录组方案可以提供不同位置区域的基因活跃信息，实现组织切片中的基因表达谱的无偏检测。从空间层面上解析RNA表达，进而解析单个组织切片中的所有mRNA，从而能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达，可以同时获得细胞的空间位置信息和基因表达数据。该技术为肿瘤生物学、肿瘤免疫微环境、发育生物学、神经科学和神经疾病以及转化医学领域的研究提供了强有力的技术手段。

 

技术参数


 


分析流程


 空间转录组流程图

 

元莘优势


10×Genomics最新单细胞分选平台，Illumina高质量测序平台，高效单细胞分选和高覆盖度测序

冷冻切片和石蜡切片的高效检测和贴片技术

高水平生信团队，为您提供优质个性化服务

一对一售后服务，高效对接项目问题

 

分析示例


1. 组织区域的完整H&E图像


2. SpaceRanger 统计并展示组织中 UMI Gene 个数在组织空间上的分布


3. graphclust_Spatial：cluster 的空间分布图


4. AUCell对spot进行基因集感应GM标记评分，解析spot对基因集感应的相关性